Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms