Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms