Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms