Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 AC008013.2-201ENST00000537555 348 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 KDM1B-203ENST00000546309 496 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 KRT73-AS1-203ENST00000552364 3808 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC02280-201ENST00000564585 3816 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 FXYD1-205ENST00000588607 619 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 MCRIP2P2-201ENST00000605276 209 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 TUG1_3.1-201ENST00000616187 237 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 RNF215-208ENST00000619645 555 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 METAP1-212ENST00000625963 147 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR3191-201ENST00000636300 76 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 PCDHB1-201ENST00000306549 8210 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 CCDC85C-201ENST00000380243 16393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 MPP2-202ENST00000377184 4206 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 CACNA1C-220ENST00000399655 13433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF529-209ENST00000591340 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 TCF4-276ENST00000635822 7805 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 UTRN-203ENST00000367526 3220 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 AKAP12-203ENST00000359755 6190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 TMC3-201ENST00000359440 4641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 MIGA1-201ENST00000370791 5288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 BTN3A1-202ENST00000289361 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF322-207ENST00000607204 4737 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 CCDC40-203ENST00000374877 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 RNF43-203ENST00000577716 4367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 ERC1-202ENST00000355446 5796 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 ARID1A-209ENST00000615191 3804 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC2A3-201ENST00000075120 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 OR2G6-203ENST00000641804 6084 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 IQUB-202ENST00000466202 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC13A3-201ENST00000279027 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 EPHB2-201ENST00000374627 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 OR2T33-202ENST00000641220 4118 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 NUP107-201ENST00000229179 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 SPATA31E3P-201ENST00000613133 4214 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 CTCFL-201ENST00000243914 3567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 APP-209ENST00000440126 2846 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 HFE-207ENST00000357618 5286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 VWA3A-202ENST00000389398 4600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 TRIM59-208ENST00000543469 4615 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 TMEM236-201ENST00000377495 5464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 KLHL24-205ENST00000454652 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 AC009403.2-202ENST00000636307 3956 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF585A-202ENST00000356958 6822 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 COL24A1-201ENST00000370571 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM217B-202ENST00000360816 5036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 TRAPPC8-211ENST00000582539 4391 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 ADNP-204ENST00000396032 4581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 PAXIP1-201ENST00000397192 3711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF181-204ENST00000492450 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 NUDCD1-201ENST00000239690 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC4A9-205ENST00000507527 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 GRB10-204ENST00000398812 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 TLR4-201ENST00000355622 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 AKAP12-202ENST00000354675 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 ST6GALNAC5-202ENST00000477717 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 ADGRG6-203ENST00000367608 6879 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 DDR1-239ENST00000452441 3857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 VPS13A-203ENST00000360280 15320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 INTS9-213ENST00000521777 2430 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 SYNPO2-204ENST00000448416 4298 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 TMEM39A-201ENST00000319172 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 NTRK3-208ENST00000557856 2622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 CRX-201ENST00000221996 4470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 PSD3-203ENST00000428502 6330 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 CSPG4P10-202ENST00000612093 3411 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 LOXHD1-211ENST00000579038 3632 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 C9orf92-202ENST00000380685 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SKP62-201ENST00000384539 329 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP35-201ENST00000391257 129 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL228P-201ENST00000470060 303 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL267P-201ENST00000485107 261 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 AC114801.1-201ENST00000512633 297 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.7 ms