Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms