Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUDCQ9Y266 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms