Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms