Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y251

HPSE, Heparanase, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPSEQ9Y251 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms