Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms