Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
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TPCN1Q9ULQ1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
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TPCN1Q9ULQ1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
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