Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PNMA8BQ9ULN7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PNMA8BQ9ULN7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PNMA8BQ9ULN7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PNMA8BQ9ULN7 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PNMA8BQ9ULN7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PNMA8BQ9ULN7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PNMA8BQ9ULN7 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PNMA8BQ9ULN7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PNMA8BQ9ULN7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PNMA8BQ9ULN7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PNMA8BQ9ULN7 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PNMA8BQ9ULN7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PNMA8BQ9ULN7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PNMA8BQ9ULN7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PNMA8BQ9ULN7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PNMA8BQ9ULN7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PNMA8BQ9ULN7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PNMA8BQ9ULN7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PNMA8BQ9ULN7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PNMA8BQ9ULN7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PNMA8BQ9ULN7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PNMA8BQ9ULN7 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PNMA8BQ9ULN7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PNMA8BQ9ULN7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PNMA8BQ9ULN7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PNMA8BQ9ULN7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PNMA8BQ9ULN7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PNMA8BQ9ULN7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PNMA8BQ9ULN7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PNMA8BQ9ULN7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PNMA8BQ9ULN7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PNMA8BQ9ULN7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms