Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK05

GDF2, Growth/differentiation factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF2Q9UK05 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF2Q9UK05 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms