Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFIP11Q9UBB9 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFIP11Q9UBB9 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFIP11Q9UBB9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFIP11Q9UBB9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFIP11Q9UBB9 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFIP11Q9UBB9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFIP11Q9UBB9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TFIP11Q9UBB9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFIP11Q9UBB9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFIP11Q9UBB9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFIP11Q9UBB9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFIP11Q9UBB9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFIP11Q9UBB9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFIP11Q9UBB9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TFIP11Q9UBB9 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFIP11Q9UBB9 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFIP11Q9UBB9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFIP11Q9UBB9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFIP11Q9UBB9 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFIP11Q9UBB9 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFIP11Q9UBB9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFIP11Q9UBB9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFIP11Q9UBB9 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFIP11Q9UBB9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFIP11Q9UBB9 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFIP11Q9UBB9 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFIP11Q9UBB9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFIP11Q9UBB9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFIP11Q9UBB9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFIP11Q9UBB9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TFIP11Q9UBB9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFIP11Q9UBB9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFIP11Q9UBB9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFIP11Q9UBB9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFIP11Q9UBB9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFIP11Q9UBB9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFIP11Q9UBB9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFIP11Q9UBB9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFIP11Q9UBB9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFIP11Q9UBB9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFIP11Q9UBB9 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TFIP11Q9UBB9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFIP11Q9UBB9 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFIP11Q9UBB9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFIP11Q9UBB9 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFIP11Q9UBB9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFIP11Q9UBB9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFIP11Q9UBB9 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFIP11Q9UBB9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFIP11Q9UBB9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms