Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms