Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.1 ms