Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOR4AQ9NXH8 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms