Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX18

SDHAF2, Succinate dehydrogenase assembly factor 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF2Q9NX18 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDHAF2Q9NX18 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms