Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms