Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms