Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms