Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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MAP1LC3CQ9BXW4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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MAP1LC3CQ9BXW4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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