Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms