Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 AL109935.1-201ENST00000413249 473 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KCTD12Q96CX2 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms