Protein–RNA interactions for Protein: Q96A56

TP53INP1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53INP1Q96A56 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TP53INP1Q96A56 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms