Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms