Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms