Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms