Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms