Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVX3

C4orf3, Uncharacterized protein C4orf3, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf3Q8WVX3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf3Q8WVX3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf3Q8WVX3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf3Q8WVX3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf3Q8WVX3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf3Q8WVX3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf3Q8WVX3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf3Q8WVX3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf3Q8WVX3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf3Q8WVX3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf3Q8WVX3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf3Q8WVX3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf3Q8WVX3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf3Q8WVX3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf3Q8WVX3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf3Q8WVX3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf3Q8WVX3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf3Q8WVX3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf3Q8WVX3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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C4orf3Q8WVX3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf3Q8WVX3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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