Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms