Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF248Q8NDW4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms