Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC191Q8NCU4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC191Q8NCU4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC191Q8NCU4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC191Q8NCU4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms