Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms