Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG4DQ86TL0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms