Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2AFVQ71UI9 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2AFVQ71UI9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms