Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms