Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms