Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VIRMAQ69YN4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms