Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
TAF3Q5VWG9 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms