Protein–RNA interactions for Protein: Q56UQ5

TPT1-like protein, humanhuman

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q56UQ5 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q56UQ5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q56UQ5 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q56UQ5 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q56UQ5 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q56UQ5 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q56UQ5 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q56UQ5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q56UQ5 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q56UQ5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q56UQ5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q56UQ5 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q56UQ5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q56UQ5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q56UQ5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q56UQ5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q56UQ5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q56UQ5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q56UQ5 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q56UQ5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q56UQ5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q56UQ5 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q56UQ5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q56UQ5 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q56UQ5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q56UQ5 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q56UQ5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q56UQ5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q56UQ5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q56UQ5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q56UQ5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q56UQ5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q56UQ5 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q56UQ5 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q56UQ5 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q56UQ5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q56UQ5 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q56UQ5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q56UQ5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q56UQ5 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q56UQ5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q56UQ5 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q56UQ5 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q56UQ5 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q56UQ5 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q56UQ5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q56UQ5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q56UQ5 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q56UQ5 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q56UQ5 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q56UQ5 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q56UQ5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q56UQ5 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q56UQ5 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q56UQ5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q56UQ5 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q56UQ5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q56UQ5 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q56UQ5 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q56UQ5 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q56UQ5 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q56UQ5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q56UQ5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q56UQ5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q56UQ5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q56UQ5 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q56UQ5 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q56UQ5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q56UQ5 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q56UQ5 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q56UQ5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q56UQ5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q56UQ5 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q56UQ5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q56UQ5 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q56UQ5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q56UQ5 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q56UQ5 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q56UQ5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q56UQ5 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q56UQ5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q56UQ5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q56UQ5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q56UQ5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q56UQ5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q56UQ5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q56UQ5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q56UQ5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q56UQ5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q56UQ5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q56UQ5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q56UQ5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q56UQ5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q56UQ5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q56UQ5 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q56UQ5 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q56UQ5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q56UQ5 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q56UQ5 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q56UQ5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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