Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms