Protein–RNA interactions for Protein: Q3MJ40

CCDC144B, Coiled-coil domain-containing protein 144B, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144BQ3MJ40 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC144BQ3MJ40 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms