Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms