Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms