Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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CTF1Q16619 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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CTF1Q16619 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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CTF1Q16619 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
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CTF1Q16619 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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