Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SGCBQ16585 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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