Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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RPE65Q16518 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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RPE65Q16518 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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RPE65Q16518 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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RPE65Q16518 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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RPE65Q16518 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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RPE65Q16518 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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RPE65Q16518 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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RPE65Q16518 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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RPE65Q16518 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
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RPE65Q16518 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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