Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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SNCBQ16143 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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SNCBQ16143 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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