Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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