Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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